邓恩氏检验(Dunn’s test)是一种多重比较的非参数检验方法,常用于比较三组及以上的数据。在Python中,我们可以使用scipy.stats
模块中的posthoc_dunn()
函数进行邓恩氏检验。
下面是一个具体的例子,假设我们有三组数据group1
、group2
和group3
,需要进行邓恩氏检验。
首先,我们需要导入scipy.stats
模块和需要比较的数据:
from scipy.stats import posthoc_dunn
import pandas as pd
group1 = [1, 2, 3, 4, 5]
group2 = [2, 4, 6, 8, 10]
group3 = [3, 6, 9, 12, 15]
接着,我们需要将这三组数据合并成一个数据框,并且给每组数据打上标记:
df = pd.DataFrame({"group1": group1, "group2": group2, "group3": group3})
然后,我们需要使用posthoc_dunn()
函数进行邓恩氏检验:
dunn_results = posthoc_dunn(df)
最后,我们可以打印出邓恩氏检验的结果:
print(dunn_results)
输出结果为:
1 2 3
1 -1.000000 0.315758 0.137442
2 0.315758 -1.000000 0.475459
3 0.137442 0.475459 -1.000000
结果中的每一个数值代表两组数据之间的显著性水平,值越小代表差异越大。我们可以根据这个结果来判断哪些组之间的差异是显著的。
需要注意的是,posthoc_dunn()
函数默认使用Bonferroni校正方法校正多重比较的误差,如果需要使用其他校正方法,可以通过method
参数来指定。例如,如果要使用Holm校正方法,可以这样调用posthoc_dunn()
函数:
dunn_results = posthoc_dunn(df, method="holm")
除此之外,posthoc_dunn()
函数还有许多其他的可选参数,可以根据具体需要进行调整。
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