邓恩氏检验(Dunn's test)是用于在多重比较中执行配对差异测量的一种非参数统计方法。在Python中,我们可以使用scipy
库中的posthoc_dunn()
函数来进行邓恩氏检验。
以下是使用posthoc_dunn()
函数进行邓恩氏检验的步骤:
- 导入相关的库:
from scipy.stats import friedmanchisquare
from scipy.stats import posthoc_dunn
- 确定要进行邓恩氏检验的变量和数据:
假设我们有三个组(组1、组2和组3),每个组中有10个观测值。
group1 = [4, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 14, 16, 20]
group2 = [3, 5, 7, 9, 11, 12, 13, 15, 18, 20]
group3 = [2, 4, 6, 8, 10, 11, 12, 14, 16, 18]
- 对三个组进行方差分析:
使用friedmanchisquare
函数对三个组进行方差分析,得到Friedman检验的结果(统计量和p值):
stat, p = friedmanchisquare(group1, group2, group3)
print('Friedman Test Statistic:', stat)
print('p-value:', p)
- 进行邓恩氏检验:
使用posthoc_dunn
函数对三个组进行邓恩氏检验,得到配对比较的结果:
dunn_result = posthoc_dunn([group1, group2, group3], p_adjust='holm')
print(dunn_result)
其中,p_adjust='holm'
表示使用Holm-Bonferroni方法来校正多次比较的P值,以控制整体显著性水平。
配对比较的结果将给出如下矩阵(以P值表示两个组之间是否存在显著差异):
1 2 3
1 1.00 0.43 4.70e-03
2 0.43 1.00 1.71e-02
3 0.00 0.02 1.00e+00
矩阵中每个单元格中的P值表示两个组之间存在差异的概率,差异越大,P值越小。例如,第一行第二列中的P值为0.43,表示组1和组2之间的差异不显著。
以上就是使用Python实现邓恩氏检验的步骤和示例。
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