GCN 图神经网络使用详解 可视化 Pytorch

yizhihongxing

下面是关于GCN图神经网络使用详解及其可视化的攻略,包含两个示例说明。

示例1:定义GCN图神经网络类

以下是一个定义GCN图神经网络类的示例:

import torch
import torch.nn as nn
import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.nn import GCNConv

class GCN(nn.Module):
    def __init__(self, num_features, hidden_size, num_classes):
        super(GCN, self).__init__()
        self.conv1 = GCNConv(num_features, hidden_size)
        self.conv2 = GCNConv(hidden_size, num_classes)

    def forward(self, x, edge_index):
        x = self.conv1(x, edge_index)
        x = F.relu(x)
        x = F.dropout(x, training=self.training)
        x = self.conv2(x, edge_index)
        return F.log_softmax(x, dim=1)

在这个示例中,我们定义了一个GCN图神经网络GCN,包含了构造函数和前向传播函数。在构造函数中,我们定义了两个GCN层。在前向传播函数中,我们首先使用第一个GCN层对输入进行处理,然后使用ReLU激活函数进行非线性变换,接着使用dropout进行正则化,最后使用第二个GCN层进行输出,并使用log_softmax进行分类。

示例2:使用GCN图神经网络进行节点分类

以下是一个使用GCN图神经网络进行节点分类的示例:

import torch
import torch.nn.functional as F
from torch_geometric.datasets import Planetoid
from torch_geometric.utils import to_networkx
import networkx as nx
import matplotlib.pyplot as plt
from GCN import GCN

# 加载数据
dataset = Planetoid(root='/tmp/Cora', name='Cora')
data = dataset[0]

# 可视化数据
G = to_networkx(data)
pos = nx.spring_layout(G, seed=42)
plt.figure(figsize=(8, 8))
nx.draw_networkx_nodes(G, pos, node_size=20, node_color=data.y, cmap='coolwarm')
nx.draw_networkx_edges(G, pos, alpha=0.5)
plt.axis('off')
plt.show()

# 定义模型
model = GCN(num_features=data.num_node_features, hidden_size=16, num_classes=dataset.num_classes)

# 定义优化器和损失函数
optimizer = torch.optim.Adam(model.parameters(), lr=0.01)
criterion = F.nll_loss

# 训练模型
model.train()
for epoch in range(200):
    optimizer.zero_grad()
    output = model(data.x, data.edge_index)
    loss = criterion(output[data.train_mask], data.y[data.train_mask])
    loss.backward()
    optimizer.step()

# 测试模型
model.eval()
output = model(data.x, data.edge_index)
pred = output.argmax(dim=1)
correct = int(pred[data.test_mask].eq(data.y[data.test_mask]).sum().item())
acc = correct / int(data.test_mask.sum())
print('Accuracy: {:.4f}'.format(acc))

在这个示例中,我们首先使用Planetoid数据集加载Cora数据集,并使用to_networkx()函数将数据集转换为NetworkX图。然后,我们使用nx.draw_networkx_nodes()函数和nx.draw_networkx_edges()函数可视化数据。接着,我们使用GCN类定义了一个GCN图神经网络,并使用Adam优化器和负对数似然损失函数进行训练。最后,我们使用model.eval()函数对模型进行测试,并输出准确率。

总结

在这个攻略中,我们介绍了如何使用GCN图神经网络进行节点分类,并使用PyTorch进行实现和可视化。在实现GCN图神经网络时,我们定义了一个GCN类,包含了构造函数和前向传播函数。在使用GCN图神经网络进行节点分类时,我们首先使用Planetoid数据集加载Cora数据集,并使用to_networkx()函数将数据集转换为NetworkX图,然后使用nx.draw_networkx_nodes()函数和nx.draw_networkx_edges()函数可视化数据。接着,我们使用GCN类定义了一个GCN图神经网络,并使用Adam优化器和负对数似然损失函数进行训练。最后,我们使用model.eval()函数对模型进行测试,并输出准确率。在实际应用中,我们可以根据具体的需求选择合适的神经网络和方法,以获得更好的预测效果。

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