python实现层次聚类的方法

Python 实现层次聚类的方法可以分为以下几个步骤:

1. 数据预处理

首先需要对数据进行处理,特别是需要将文本数据转化为数值型数据,以便于聚类算法的执行。可以使用各种文本特征提取技术来实现。

2. 选择合适的距离度量

距离度量是衡量两个样本之间的差异程度的方法。在层次聚类中,比较常用的距离度量包括欧几里得距离、曼哈顿距离、余弦距离等。选择何种距离度量策略,可以根据数据的特征和问题需求来理性决策。

3. 层次聚类算法

层次聚类是将所有样本逐层地划分为组的过程,一般分为两种:凝聚方法和分裂方法。凝聚方法从单个样本开始,将最接近的样本依次合并至形成一个组;而分裂方法从所有样本作为一个组开始,将一些样本逐层地拆分为新组。

以下示例展示了单链聚类和全链聚类的python实现:

单链聚类代码示例:

from scipy.cluster.hierarchy import linkage
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
import matplotlib.pyplot as plt

# 输入数据
X = [[1,1], [1.5,1.5], [3,3], [4,4], [3.5,3.5], [3,2], [2,3], [5,4]]

# 单链聚类
Z = linkage(X, method='single')

# 绘制树状图
plt.figure(figsize=(8, 5))
dendrogram(Z)
plt.show()

全链聚类代码示例:

from scipy.cluster.hierarchy import linkage
from scipy.cluster.hierarchy import dendrogram
import matplotlib.pyplot as plt

# 输入数据
X = [[1,1], [1.5,1.5], [3,3], [4,4], [3.5,3.5], [3,2], [2,3], [5,4]]

# 全链聚类
Z = linkage(X, method='complete')

# 绘制树状图
plt.figure(figsize=(8, 5))
dendrogram(Z)
plt.show()

4. 决定聚类簇的数量

在树状图显示的层次结构决定聚类簇时,需要使用数据工作量最小的方式确定划分。在这个过程中,我们可以尝试各种阈值,以量化聚类之间的不同程度(如每个聚类之间的距离、平均距离等),从而找到最佳的聚类簇数目。

综上所述,python实现层次聚类的方法可以采用一个综合的框架:数据预处理、距离度量、层次聚类算法、决定聚类簇的数量。我们可以根据需求在这个框架下灵活使用对应的库函数,并结合各种示例进行实践操作。

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