ITK 实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件案例

下面我来详细讲解“ITK 实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件案例”的完整攻略。

首先要明确文件格式，nii.gz是一种压缩的nifti格式，而mha则是MetaImage格式，它们都支持存储多维图像数据。而ITK（Insight Segmentation and Registration Toolkit）则是一个用于医学图像处理领域的开源工具库，支持多种图像数据格式，可以用来进行图像处理、分割和配准等任务。

下面是ITK实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件的攻略：

1. 安装ITK

首先，需要在本地安装ITK，并将其添加到系统环境中。可以在ITK官网（https://itk.org/）上下载对应版本的ITK源代码，并按照官方文档进行安装。

2. 读取多个图像

使用ITK读取多张图像，可以使用itk::ImageSeriesReader类，该类可以按照顺序读取文件夹中的多张图像，并将它们组合成一个三维图像对象。以下是示例代码：

#include "itkImageSeriesReader.h"

typedef itk::Image<float, 3> ImageType;
typedef itk::ImageSeriesReader<ImageType> ReaderType;

ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
reader->SetImageIO( itk::GDCMImageIO::New() );
reader->SetFileNames( DICOMNames );
reader->Update();

上述代码中，DICOMNames是一个包含图像文件路径的vector变量。

3. 存储为单个nii.gz文件

使用ITK将多张图像存储为单个nii.gz文件，可以使用itk::ImageFileWriter类，该类可以将图像对象存储为指定格式的文件。以下是保存为nii.gz格式的示例代码：

#include "itkImageFileWriter.h"
#include "itkMetaImageIOFactory.h"

itk::MetaImageIOFactory::RegisterOneFactory();

typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;

WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
writer->SetFileName( "output.nii.gz" );
writer->SetInput( reader->GetOutput() );
writer->Update();

上述代码中，ImageType是从多张图片组合得到的三维图像对象。

4. 存储为单个mha文件

使用ITK将多张图像存储为单个mha文件，同样可以使用itk::ImageFileWriter类，不过需要将文件格式设置为MetaImage格式。以下是保存为mha格式的示例代码：

#include "itkImageFileWriter.h"
#include "itkMetaImageIO.h"

typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;

WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
writer->SetFileName("output.mha");

itk::MetaImageIO::Pointer metaWriter = itk::MetaImageIO::New();
metaWriter->SetDoublePrecision(6);
writer->SetImageIO(metaWriter);
writer->SetInput(reader->GetOutput());
writer->Update();

上述代码中，ImageType是从多张图片组合得到的三维图像对象。

以上是ITK实现多张图像转成单个nii.gz或mha文件的攻略，使用上述方法可以方便地进行多张图像组合和存储操作。