.img/.hdr格式转.nii格式的操作

将.img/.hdr格式转换为.nii格式，需要使用到FSL或AFNI两种工具之一。下面我将分别介绍这两种工具的操作步骤。

使用FSL转换格式

1. 准备工作

首先，确保你已经安装了FSL，并将它的环境变量设置正确。同时，请确保你的.img/.hdr文件在同一个文件夹下，文件名相同。

2. 执行转换命令

在命令行中输入以下命令：

fslchfiletype NIFTI <filename>

其中<filename>是.img/.hdr文件的文件名，不需要输入扩展名。运行该命令后，将会生成一个.nii文件。

3. 查看转换结果

使用FSLView或其他可视化工具对.nii文件进行打开，查看文件是否成功转换。如果成功转换，则原.img/.hdr文件与转换后的.nii文件在图像上应当完全一致。

使用AFNI转换格式

1. 准备工作

首先，确保你已经安装了AFNI，并将它的环境变量设置正确。同时，请确保你的.img/.hdr文件在同一个文件夹下，文件名相同。

2. 执行转换命令

在命令行中输入以下命令：

3dcopy <filename>.hdr <filename>.nii.gz

其中<filename>是.img/.hdr文件的文件名，不需要输入扩展名。运行该命令后，将会生成一个压缩后的.nii.gz文件。

3. 查看转换结果

使用AFNI或其他可视化工具对.nii.gz文件进行打开，查看文件是否成功转换。如果成功转换，则原.img/.hdr文件与转换后的.nii.gz文件在图像上应当完全一致。

示例一：

假设我们的.img/.hdr文件名为example，那么我们在命令行中输入以下命令：

对于FSL：

fslchfiletype NIFTI example

对于AFNI：

3dcopy example.hdr example.nii.gz

成功转换后，将在该文件夹下生成一个.nii文件或.nii.gz文件。

示例二：

假设我们的.img/.hdr文件名为test，那么我们在命令行中输入以下命令：

对于FSL：

fslchfiletype NIFTI test

对于AFNI：

3dcopy test.hdr test.nii.gz

成功转换后，将在该文件夹下生成一个.nii文件或.nii.gz文件。